Вычислительная математика и математическое моделирование
Описание работы кальций-высвобождающих каналов (RyR-каналов) – одна из ключевых задач при моделировании динамики концентраций Ca2+ в сердечных клетках. В экспериментальных работах на изолированных RyR-каналах выявлено влияние множества различных факторов на вероятности их открытия и закрытия. Однако построенные с учетом экспериментальных данных модели Ca2+-высвобождающих единиц, состоящих из небольших групп каналов (кластеров), не позволяют адекватно описать согласованное открытие каналов в ответ на стимул, согласованное их закрытие при завершении высвобождения, а, следовательно, и процесс высвобождения в целом. По-видимому, решение проблемы кроется как в специфике динамики изолированного канала, так и в наличии кооперативных взаимодействий между каналами.
Нами построена электронно-конформационная модель нелинейной динамики решетки RyR-каналов, позволяющая описать работу кластера RyR-каналов и исследовать роль кооперативных взаимодействий между ними в обеспечении их согласованного открытия и закрытия. Основываясь на подходе оператора энергии, широко используемом в физике, было получено описание динамики индивидуального RyR-канала и кластера каналов. При численном моделировании выявлены различные моды поведения кластера в ответ на стимуляцию. Показано, что кооперативные взаимодействия могут являться одним из ключевых механизмов, обеспечивающих согласованное поведение каналов, как при открытии, так и при их закрытии. Кроме того, модель способна описать другие основные свойства процесса высвобождения Ca2+ в сердечных клетках, таких как нелинейное усиление ответа высвобождающих структур на возрастание величины стимула и адаптацию высвобождения к повторной стимуляции.
Работа поддержана грантами РФФИ (03-04-48260), CRDF (REC 005), The Wellcome Trust (074152).
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции
Ваши комментарии Обратная связь |
[Головная страница] [Конференции] |
© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск