International Union for Circumpolar Health Ministry of Public Health and Social Development of RF Russian Academy of Medical Sciences Siberian Branch of Russian Academy of Medical Sciences Siberian Branch of Russian Academy of Sciences Medical Polar Fund “Science” The Northern Forum

Тезисы докладов

Генетика, демография, антропология

Архитектура неравновесия по сцеплению в геноме человека является в настоящее время предметом оживленных дискуссий и интенсивных исследований. Анализ неравновесия по сцеплению может дать новую информацию о происхождении и эволюции человека, а также выявить популяционные и демографические сценарии, наблюдавшиеся в истории формирования генофонда различных популяций.

В данной работе мы исследовали частоты генотипов, гаплотипов, а так же сцепление по трём SNPs, локализованных в гене множественной лекарственной устойчивости (MDR1). Ген множественной лекарственной устойчивости (MDR1), кодирует трансмембранный P-гликопротеин, обеспечивающий перенос из клетки наружу широкого спектра веществ (ксенобиотики, лекарственные препараты, пептиды, вирусные частицы). Размер гена составляет 210 kb., он содержит 30 экзонов. Ряд работ показывают участие данного гена в формировании устойчивости к инфекциям, следовательно, полиморфизм в гене MDR1 может иметь приспособительное значение.

В качестве маркеров были выбраны три SNP: С3435Т, -1G/A и +139C/T. Материалом исследования служили три выборки: русские г.Томск (90); тувинцы Бай-Тайга, республика Тыва (142); киргизы южные Киргизстан (44), киргизы северные Киргизстан (41). Генотипирование проводили при помощи полимеразной цепной реакции и полиморфизма длины рестрикционных фрагментов.

Результат: локусы С3435Т и +139C/T для всех четырёх популяций оказались высокополиморфными (Hobs от 0,43 до 0,50 за исключением южных киргизов по локусу +139C/T - Hobs=0,23). Для локуса -1G/A по всем выборкам наблюдался низкий уровень полиморфизма (Hobs от 0,00 у тувинцев до 0,03 у русских).

Распределение гаплотипов носило сходный характер – суммарная частота гаплотипов С3435,-1G,+139C; 3435Т,-1G,139C и 3435Т,-1G,+139T варьировала от 82% у тувинцев до 99% у северных киргизов. Число гаплотипов среди изученных популяций различалось от 4 у тувинцев до 7 у русских. Было выявлено сцепление между локусами С3435Т и +139C/T среди русской и южной киргизской популяций. Распределение генотипов соответствовало равновесию Харди-Вайнберга с уровнем значимости 0,95 для всех выборок и по всем локусам.

Выводы: частоты аллелей по локусам С3435Т, -1G/A и +139C/T среди исследованных популяций находятся в рамках мировых частот, наличие сцепления между локусами С3435Т и +139C/T согласуется с данными о блочной структуре неравновесия по сцеплению и существовании «горячих точек» рекомбинации, так как в случае равномерной рекомбинации вероятность сцепления между локусами +139C/T и -1G/A была бы выше, чем между локусами С3435Т и +139C/T, потому что дистанция между ними составляет 34kb и 57kb соответственно.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

© 1996-2005, Сибирское отделение Российской Академии медицинских наук, Новосибирск
Последнее обновление: 06-Jul-2012 (11:52:05)