Конференции ИВТ СО РАН



Международная конференция
«Вычислительные и информационные технологии
в науке, технике и образовании»

Павлодар, Казахстан, 20 – 22 сентября 2006 года

Тезисы докладов


Пакет прикладных генетико-селекционных программ для персональных компьютеров

Дромашко С.Е.

Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси (Минск)

В настоящее время отсутствуют современные объектно-ориентированные программные средства для обработки генетико-селекционных данных и оптимизации и ускорения процесса количественной оценки нового генофонда по показателям продуктивности с учетом влияния факторов среды (уровень урожайности в зависимости от почвенно-климатических факторов, устойчивость к основным биотическим и абиотическим стрессам, минимизация приемов интенсификации выращивания). Имеющиеся статистические пакеты, например SYSTAT, STATGRAPH или STATISTICA, нацелены на обработку обезличенных данных и поэтому не включают блока генетико-статистического анализа, учитывающего специфику требований селекционера.

Институт генетики и цитологии НАН Беларуси является ведущим учреждением республики в области математической генетики и моделирования селекционного процесса. Более 30 лет в институте разрабатываются прикладные программы для ЭВМ по генетико-статистическому анализу экспериментальных данных и математическому моделированию. Появление в конце 1980-х годов персональных компьютеров позволило поставить задачу объединения уже накопленного багажа программ в единый пакет, соответствующий современному уровню требований по части удобства и легкости его использования. К 1995 г. под операционную систему MS DOS был создан пакет прикладных программ для персональных компьютеров РИШОН по различным видам биометрического анализа (элементарный статистический, корреляционный, дисперсионный, многомерный, генетический). В отличие от других программных биометрических продуктов того периода, таких как DAVEP-PC (Германия), Биостат (Молдова), пакет РИШОН ориентирован на запросы генетиков и селекционеров, в первую очередь растениеводов.

Нацеленность на генетику сельскохозяйственных растений позволила внедрить пакет в практику учебного и научно-исследовательского процессов на биологическом факультете Гомельского государственного университета, ряде кафедр Белорусской государственной сельскохозяйственной академии. Пакет был также передан для использования на Опытную станцию по птицеводству НАН Беларуси, в Институт генетики и физиологии хлопчатника АН Таджикистана.

Однако за 10 прошедших лет дизайн пакета РИШОН, ориентированный на MS DOS, морально устарел. Назрела необходимость перевода пакета на современную платформу. В начале 2000-х годов нами была предпринята попытка разработки комплексной программы теоретико-информационного анализа генетических процессов у сельскохозяйственных растений с учетом влияния факторов окружающей среды с использованием формализма MS Excel. С учетом этого опыта представляется перспективным модернизировать пакет, оснастив его современным пользовательским интерфейсом на платформе MS Windows. Это позволит в современной, удобной и привычной для пользователей среде реализовать системный подход, позволяющий осуществить весь комплекс необходимых вычислений, в частности провести генетико-статистическую обработку данных на ЭВМ, дать количественную оценку перспективности тех или иных генотипов для использования в селекционном процессе, спланировать оптимальные севообороты, сделать расчеты наиболее экономичного использования удобрений и препаратов химической защиты растений и т.д. В этом случае пакет будет востребован в учебных, научно-исследовательских и селекционных учреждениях Беларуси и стран СНГ и явится хорошим примером использования информационных технологий для оптимизации и ускорения селекционного процесса.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции



Ваши комментарии
Обратная связь
[ICT SBRAS]
[Головная страница]
[Конференции]

© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск