Конференция, посвященная 90-летию со дня рождения Алексея Андреевича Ляпунова

Россия, Новосибирск, Академгородок, 8 - 11 октября 2001 года,
(номер государственной регистрации 0320300063)

Тезисы докладов

Информационная биология

База данных по транскрипционным регуляторным районам генов

Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Меркулова Т.И., Подколодный Н.Л., Наумочкин А.Н., Коростышевская И.М., Ромащенко А.Г., Колчанов Н.А.

Институт цитологии и генетики СО РАН (Новосибирск)

Transcription Regulatory Regions Database (TRRD) разрабатывается и поддерживается в Institute of Cytology and Genetics SB RAS (Nivosibirsk, Russia) с 1993.

TRRD содержит экспериментальную информацию об особенностях структурно-функциональной организации регуляторных районов генов эукариот. Информация заносится в базу данных экспертами-биологами на основании аннотирования экспериментальных статей.
Каждый вход в базу TRRD соответствует отдельному гену и содержит описание таких иерархических уровней регуляции транскрипции как 1) сайты связывания транскрипционных факторов; 2) регуляторные единицы (промоторы, энхансеры, сайленсеры); 3) регуляторные районы (5' 3' регуляторные районы, экзоны, интроны).

Описание каждого уровня регуляции может включать как его структурные характеристики (последовательность, локализация), так и функциональные свойства (влияние на транскрипционную активность гена, специфичность функционирования на определенных стадиях клеточного цикла или этапах индивидуального развития, а также в конкретных типах клеток, тканях и органах).

Помимо данных о регуляторных районах гена в базу вносятся также описания транскрипционных факторов, использованных в экспериментах по исследованию связывающей способности либо функциональной активности сайтов, паттерны экспрессии генов, а также ссылки на исходные публикации.

TRRD является частю системы GeneExpress.

Доступ к базе возможен по адресу http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/trrd/.

Дополнительные материалы: HTML
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии

[Головная страница]
[Конференции]
[СО РАН]

© 2001, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
© 2001, Объединенный институт информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт математики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Новосибирский государственный университет
Дата последней модификации 06-Jul-2012 (11:45:21)