Конференция, посвященная 90-летию со дня рождения Алексея Андреевича Ляпунова

Россия, Новосибирск, Академгородок, 8 - 11 октября 2001 года,
(номер государственной регистрации 0320300063)

Тезисы докладов

Информационная биология

Моделирование генных сетей с помощью обобщенного химико-кинетического метода

Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Ратушный А.В., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А.

Институт Цитологии и Генетики (Новосибирск)

В статье описан обобщенный химико-кинетический метод моделирования, позволяющий гибко и адекватно строить модели разнообразных биосистем. Этот метод обеспечивает точное и эффективное портретное моделирование закономерностей функционирования генных сетей в силу того, что его компьютерная реализация адекватно отображает фундаментальные свойства биосистем. Обобщенный химико-кинетический метод моделирования (ОХКММ) ориентирован на формализованное, в первую очередь портретное, описание функционирования произволь ных биосистем. Формализация осуществляется на основе блочного принципа, согласно которому моделируемая система расчленяется на элементарные подсистемы, каждая из которых описывается изолированно от других. Описание элементарных подсистем проводится в терминах элементарных процессов. В качестве примеров использования метода приводятся адекватные математические модели сложных нелинейных генных сетей: системы регуляции холестерина в клетке и дифференциации и созревания эритроцита. Для генной сети системы регуляции биосинтеза холестерина в клетке были построены гаплоидная и диплоидная модели. Модели были записаны в терминах элементарных процессов - биохимических реакций. Были также определены оптимальные наборы параметров и численно промоделировано поведение моделей при различных условиях. Модели позволяют исследовать возможные функциональные состояния этих генных сетей, рассчитывать последствия мутаций и определять оптимальные стратегии их коррекции, в том числе терапевтическими мерами. Графический интерфейс пользователя для для расчета динамики этих моделей доступен по адресу http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/systems/MGL/GeneNet/

Дополнительные материалы: HTML
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии

[Головная страница]
[Конференции]
[СО РАН]

© 2001, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
© 2001, Объединенный институт информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт математики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Новосибирский государственный университет
Дата последней модификации 06-Jul-2012 (11:45:21)