Тезисы докладов

В настоящее время прогресс, достигнутый в экспериментальных и теоретических методах получения новых знаний о структуре и функции биологических макромолекул, вызвал экспоненциальный рост накапливаемой молекулярно биологической информации. Этот процесс совместно с процессом эволюции компьютерных технологий информационно-вычислительных ресурсов предопределяет ряд важнейших проблем по созданию новых молекулярно биологических баз данных и трансформации существующих в соответствии с требованиями, предъявляемыми современными условиями. Одной из самых значительных, с научной точки зрения, является база пространственных структур и функций ДНК, РНК и белков PDB. PDB содержит информацию как о координатах атомов макромолекул, так и основополагающие данные по особенностям и функциям макромолекул. Входом в PDB является отдельно взятый файл, данные в котором представлены во флэт формате. При разработке формата PDB в значительной степени учитывалась эффективность восприятия информации человеком, а не эффективность компьютерных операций по поиску и доступу к ней. Целью настоящей работы было создание новой структуры и формата базы данных пространственных структур макромолекул для интеграции этой базы в составе электронной библиотеки. В результате проделанной нами работы были сформированы форматы записей, позволяющие наиболее полно проводить SRS индексацию.

Поскольку содержащаяся в PDB информация обладает чрезвычайно большой емкостью, охватывая самые различные структурные и биологические характеристики макромолекул, встает задача организации пользователем поисковых запросов, основанных на множестве критериев. При этом, ряд критериев могут быть более предпочтительными по отношению к другим. Для решения данной задачи предложен подход формирования сценариев запросов, содержащих взвешенные по предпочтительности критерии. Такой подход является новым для молекулярно-биологических информационных ресурсов, и, как ожидается, может в значительной степени обеспечить гибкость и простоту поискового процесса для пользователя.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии А.М.Федотов

[Головная страница] [Конференции] [СО РАН]

© 1999, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск