IV рабочее совещание по электронным публикациям - EL-PUB-99

Новосибирск, Академгородок, ИВТ СО РАН, 21 - 23 апреля 1999 года.

Тезисы докладов

Дочерние базы знаний по пространственным структурам и функциям ДНК, РНК и белков в системе ГЕНЭКСПРЕСС

Куропатов Д.А., Григорович Д.А., Фролов А.С., Пономаренко М.П., Подколодный Н.Л., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А.

Институт Цитологии и Генетики СО РАН (Новосибирск)

Проблема создания баз данных по особенностям пространственных структур ДНК, РНК и белков в настоящее время является одной из актуальных задач в молекулярной биологии. В первую очередь, это вызвано возросшим значением знаний об особенностях пространственной организации макромолекул в современных молекулярно-биологических исследованиях. Практически ни одно из исследований по разработке профилактических, диагностических или лекарственных препаратов, а также изучению функции белков и других макромолекул не может быть качественно выполнено без таких знаний.

В базе данных PDB содержится информация о координатах атомов макромолекул. С использованием координат атомов могут быть рассчитаны многие структурные особенности макромолекул. Базы данных, содержащие такие структурные особенности принято называть дочерними. Создание и интеграция дочерних баз в электронной библиотеке пространственных структур ДНК, РНК и белков открывает принципиально новые возможности данного информационного ресурса.

Анализ задач молекулярно-биологических исследований позволил нам выделить ряд признаков пространственных структур, имеющих важное прикладное и фундаментальное значение в научных исследованиях. Одним из таких признаков являются пространственные характеристики активных сайтов, а также сайтов связывания в белках. Разработан способ расчета, накопления и представления такой информации в базе данных.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии
А.М.Федотов

[Головная страница]
[Конференции]
[СО РАН]