|
Сибирское отделение РАН |
Разнообразие животного мира
В простейшем виде база данных признаков (со многими состояниями) состоит из двух связанных таблиц: 1) матрицы таксоны/признаки, (представленной записями подчиненных таксонов с полями признаков кодированных номерами состояний) и 2) таблицы признаков и их состояний (представленной записями названий признаков и состояний, с полями номеров признаков и состояний). Филогенетические программы используют для анализа матрицу представленную записями подчиненных таксонов c колонками признаков, кодированных по степени продвинутости в эволюционном ряду, начиная от 0-состояния. Очевидно, что матрица, используемая филогенетическими пакетами, по логической структуре соответствует первой таблице баз данных признаков. Ключевая задача филогенетического использования таблицы базы признаков – сведение многих таблиц базы данных признаков к одной матрице, ранжирование состояний признаков по степени продвинутости, начиная от 0-состояния, выявление филогенетически значимых признаков, анализ ограничений, связанных с средним допустимым числом реверсий для конкретных таксонов организмов. В филогенетическом анализе используются также признаки, непригодные для обычной идентификации – экологические (специфичность к хозяину и объекту питания, тип жизненного цикла), молекулярные последовательности нуклеиновых кислот и протеинов – они вносятся в матрицу дополнительно и также подвергаются анализу на степень филогенетической значимости (точнее, пригодности для построения парзимонических гипотез филогении). Любой признак может быть оценен по его диагностической, филогенетической и эволюционной значимости для таксона. На примерах таксонов нематод, обитающих в Евразии, показано использование баз данных признаков для идентификации и моделирования филогении.
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции
Ваши комментарии Обратная связь |
[Головная страница] [Конференции] |
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)