Тезисы докладов

Генетические основы биоразнообразия

Известно более 10 секвенированных геномов хлоропластов, что позволяет с помощью информационных технологий анализировать их в сравнительном аспекте. В настоящем сообщении приведены результаты сравнительного анализа геномов и функциональных участков ДНК хлоропластов 15 видов растений по составу нуклеотидов. Нами установлено, что несмотря на значительную гетерогенность участков ДНК по частоте использования нуклеотидов (fA,fT,fG,fC), существует ограничение на относительное изменение содержания нуклеотидов в однонитевой ДНК, названное нами как правило четырех нуклеотидов (ПЧН) - разность отношений частот использования комплементарных нуклеотидов пропорциональна содержанию пуринов (fR): fA/fT - fC/fG = a(fR-0,5) + b, где а и b - параметры линейной регрессии. Для W-ДНК геномов хлоропластов получены следующие уравнения регрессии, отражающие ПЧН:

Название объекта	ДНК, н.	Уравнение регрессии	r± Sr
Arabidopsis thaliana Cyanophora paradoxa Chlorella vulgaris Euglena gracilis Epifagus virginiana Marchantia polymorpha Mesostigma viride Nicotiana tabacum Oryza sativum Odontella sinensis Porphyra purpurea Pinus thunbergiana Spinacia oleracea Toxoplasma gondii Zea mays	154478 135599 150613 143172 70028 121024 118360 155939 134525 119704 191028 119707 150725 34944 140387	дельта=7,45(fR-0,5)-0,008 дельта=7,81(fR-0,5)-0,026 дельта=6,97(fR-0,5)-0,003 дельта=2,59(fR-0,5)-0,112 дельта=7,83(fR-0,5)-0,001 дельта=6,76(fR-0,5)+0,001 дельта=8,21(fR-0,5)-0,021 дельта=7,53(fR-0,5)-0,007 дельта=7,63(fR-0,5)-0,002 дельта=8,39(fR-0,5)-0,013 дельта=8,22(fR-0,5)-0,003 дельта=8,05(fR-0,5)-0,005 дельта=7,57(fR-0,5)-0,001 дельта=9,52(fR-0,5)-0,034 дельта=7,79(fR-0,5)-0,002	0,968± 0,036 0,946± 0,049 0,968± 0,036 0,354± 0,422 0,980± 0,043 0,895± 0,072 0,906± 0,070 0,964± 0,038 0,983± 0,028 0,984± 0,029 0,982± 0,024 0,987± 0,027 0,968± 0,036 0,957± 0,097 0,985± 0,026

где Δ= fA/fT – fC/fG, а r-Sr коэффициент корреляции с ошибкой. Отличие характеристик генома E.gracilis обусловлено тем, что в этом геноме, по-видимому, произошла рекомбинация ДНК в точке около 70000 н. Так, если соединить W-ДНК до этой точки и С-ДНК после нее, то ПЧН отражается уравнением: Δ=5,05(fR-0,5)+0,196, r-Sr=0,925-0,058. Анализ генов белков, тРНК, рРНК, интронов и межгенных участков ДНК некоторых из изученных геномов показал хорошее соответствие ПЧН этих участков и ПЧН целой ДНК геномов хлоропластов.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)