Тезисы докладов

Водные экосистемы

Клонирование генов бактериальной биолюминесценции в различных микро-организмах дает возможность изучения адаптации и выживаемости бактерий, ста-бильности сохранения и экспрессии рекомбинантных генов в различных условиях существования. Использование маркерных lux-генов облегчает мониторинг рас-пространения трансгенных микроорганизмов в различных системах. Для клони-рования используются промоторы и регуляторные гены других - нелюминесцент-ных – оперонов; могут клонироваться все lux-гены или их часть, причем из раз-личных, в том числе эукариотических организмов. Однако информация о созда-нии и использовании штаммов микроорганизмов с клонированными генами лю-минесцентной системы информация остается в значительной степени неструкту-рированной и рассеянной; ее накопление в одном легкодоступном источнике мо-жет оказать огромную помощь исследователям, работающим над проблемами биотехнологии, биоремедиации, биотестирования, молекулярной биологии и в ряде других областей науки.

Создаваемая база данных (БД), содержащая информацию о светящихся мик-роорганизмах – BiolumBase, включает и раздел по трансгенным штаммам микро-организмам. Такая система объединит легко- и сложноформализуемые характери-стики соответствующих объектов, давая возможность предоставлять как тексто-вую, так и графическую информацию. Структура БД позволит хранить и отобра-жать по возможности более полную информацию о содержащихся объектах. Кро-ме того, предусмотрены отдельные разделы как по использованным при подго-товке БД литературным публикациям, так и по Web-ссылкам на соответствующие ресурсы глобальной сети, в том числе и на Web-страницы мировых коллекций микроорганизмов и клонированных генетических систем.

На данном этапе структура раздела BiolumBase по трансгенным светящимся микроорганизмам полностью разработана; проводится работа по переносу струк-туры БД на уровень физических таблиц в системе Power Builder и разработке про-грамм пользовательского интерфейса и обработки запросов, что сделает возмож-ным наполнение БД информацией с последующим предоставлением доступа к ней через сеть Интернет. Собрана информация о более чем 300 штаммах с клони-рованными люминесцентными системами. В перспективе планируется значитель-ное расширение этого объема.

В заключение следует отметить, что данное описание структуры BiolumBase представляет собой начальный этап ее разработки и подразумевает возможность модификации структуры БД с учетом перспектив дальнейшего развития.

Работа поддержана грантами РФФИ № 00-07-90111, № 01-07-06002-мас и № 01-07-06003-мас.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)