Тезисы докладов

Изменчивость генома человека

Митохондриальная ДНК (мтДНК) человека характеризуется высоким уровнем изменчивости, что делает ее важным источником генетической информации, используемой в исследованиях в области этнической генетики и биомедицины. Известно, что изменчивость мтДНК обусловлена преимущественно точечными мутациями, однако механизмы мутагенеза митохондриального генома во многом остаются неясными. Можно предположить, что мутационные процессы предерминированы контекстом ДНК, т.е. в митохондриальном геноме имеются определенные нуклеотидные мотивы ДНК, характеризующиеся повышенной вариабельностью. В связи с этим нами проведен поиск коротких гипервариабельных нуклеотидных мотивов, основанный на анализе данных об изменчивости мтДНК в популяциях человека. С использованием данных о рестрикционном полиморфизме мтДНК обнаружено, что наиболее полиморфными являются нуклеотидные мотивы GGCC, AGCT, GTAC (узнаваемые, соответственно, рестриктазами HaeIII, AluI и RsaI) и их однонуклеотидные производные AGCC, GACC, GGTC, GCAC. Высокая изменчивость указанных нуклеотидных мотивов характерна и для главной некодирующей области - наиболее вариабельного участка митохондриального генома. Для того, чтобы определить, какие из нуклеотидных позиций этого участка мтДНК являются гипервариабельными нами проанализирована частота появления идентичных мутаций в последовательностях мтДНК, относящихся к различным филогенетическим группам типов мтДНК человека. В итоге в участке длиной 360 пар нуклеотидов обнаружены 14 нуклеотидных позиций, мутации в которых возникли независимо в 6 из 15 проанализированных групп мтДНК. Контекстный анализ распределения гипервариабельных позиций в главной некодирующей области мтДНК позволил выявить три типа мотивов - GTAC, ACCC и CCTC, характеризующихся повышенным мутагенезом в отношении точечных замен. Установлено, что эти гипервариабельные мотивы часто наблюдаются в виде прямых повторов, в том числе тандемных. Более того, мотивы CCTC и ACCC, как элементы более протяженных поли-С трактов, входят в состав прямых повторов, ассоциированных с делециями и тандемными дупликациями мтДНК человека. Полученные данные позволяют считать, что нестабильность митохондриального генома человека обусловлена, в значительной мере, мутационными процессами, предетерминированными контекстом ДНК.

Работа поддержана грантами РФФИ (00-06-80448) и ГНТПР «Приоритетные направления генетики (99-04-30).

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)