Тезисы докладов

Водные экосистемы

Светящиеся бактерии, обладая уникальным визуальным маркером, являются удобным объектом для решения многих фундаментальных проблем и практически важных задач медицины, экологии, биотехнологии. Биолюминесценция может быть использована в качестве источника информации о процессах в клетках и популяциях, пространственной структуре вод океана. Многолетние работы по морской биолюминесценции привели к созданию уникальной коллекции морских светящихся бактерий (КК ИБСО), которая содержит более 700 штаммов, выделенных из различных точек Мирового океана, и типовые штаммы светящихся бактерий. КК ИБСО служит базой для получения векторов с люминесцентными генами, клонируемыми в различные организмы, для поиска продуцентов различных целевых продуктов, а также для разработки биолюминесцентного биотеста. На базе Коллекции создаются демонстрационные средства для лабораторных работ в высшей и средней школе.

Создаваемая в коллекции ИБСО база данных о поддерживаемых в ней светящихся бактериях является разделом базы данных BOLUMBASE. При разработке структуры базы данных учитывалась необходимость отразить все многообразие свойств и связей рассматриваемых объектов, обеспечить быстрый способ получения информации о любом интересующем атрибуте. Проектирование информационной системы производилось с помощью CASE-средств Platinum Technology ERWin 3.5.2. В базе данных кроме словесных описаний и формализованных данных предусмотрено использование схем, графиков, фотографий. Структура базы данных электронной коллекции представляет собой систему связанных определенными отношениями таблиц, каждая из которых описывает ту или иную информационную категорию (сущность), характеризуемую рядом признаков (атрибутов), достаточно полно ее определяющих. Подраздел "Метаболические реакции" характеризует свойства, важные для определения таксономического положения штамма и его практического использования. Он отражает основные физиолого-биохимические характеристики штаммов, данные о продукции витаминов, экзоферментов, запасных веществ, которые могут быть востребованы в биотехнологии. Подраздел "Люминесцентная система" является одним из ключевых для раздела "Природные микроорганизмы" и БД BIOLUMBASE в целом. В нем представлены многогранные сведения о люминесцентной системе светящихся бактерий: феноменология, структура, кинетические характеристики, связь с общим метаболизмом клетки, влияние на люминесценцию физико-химических факторов, регуляция и контроль экспрессии lux-генов, области применения. Именно этот подраздел является звеном, через которое будет осуществляться связь с другими разделами разрабатываемой БД BIOLUMBASE. Пользователи смогут получить не только каталожную информацию о штаммах, но и сведения о свойствах, функциях, использовании, литературных источниках, произвести поиск штаммов по произвольному набору признаков.

Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 00-07-90111.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)