Сибирское отделение РАН 
Институт цитологии и генетики



Первое международное рабочее совещание "Биоразнообразие и динамика экосистем Северной Евразии: информационные технологии и моделирование" (WITA-2001)

9-14 июля 2001 года, Новосибирск, Россия

Тезисы докладов


Изменчивость генома человека

Популяционная Динамика Влияет На Генетические Расстояния И Оценки Времени Дивергенции Популяций

Животовский Л.А.

Институт общей генетики РАН (Москва)

Генетические расстояния играют важную роль для оценки времени дивергенции популяций. Однако их интерпретация сильно осложняется наличием демографических процессов, таких как миграция и динамика численности. Как правило, генетические расстояния предполагают постоянную численность популяции, отсутствие генных потоков между ними и их генетическое равновесие. Если эти предположения не выполняются, то оценки времени дивергенции могут быть далеки от фактических величин. Например, широко распространённая мера расстояния для микросателлитных локусов (δμ)2 (Goldstein et al. 1995) занижает время дивергенции, если разделившиеся популяции увеличиваются в численности или связаны миграционными потоками. Нами предложена иная оценка времени дивергенции по данным о микросателлитной изменчивости, TD, которая не предполагает генетического равновесия, независима от изменения численности при отсутствии миграций и мало зависит от слабых миграционных потоков для растущих популяций (Zhivotovsky 2001). Однако для её применения необходимо знать о микросателлитной изменчивости (дисперсии числа повторов) в момент разделения популяций. Предложено несколько подходов для решения возникающей проблемы, которые были апробированы на данных по изменчивости аутосомных STR-локусов с ди-, три- и тетра-нуклеотидными повторами в различных популяциях человека. Применение TD дало 57 and 135 тысяч лет в качестве нижней и верхней оценок времени отделения вне-африканской ветви анатомически современного человека от африканского предка. Кроме того, показано, что разделение азиатской и европейской ветвей произошло 20 тысяч лет спустя после появления вне-африканской ветви (Zhivotovsky 2001).

Literature.
Goldstein, D. B., A. R. Linares, L. L. Cavalli-Sforza, and M. W. Feldman. 1995. Genetic absolute dating based on microsatellites and the origin of modern humans. Proc. Natl. Acad. Sci. 92: 6723-6727.
Zhivotovsky, LA. 2001. Estimating divergence time with use of microsatellite genetic distances: impacts of population growth and gene flow. Mol. Biol. Evol. 18: 700-709.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции



Ваши комментарии
Обратная связь
[ICG SBRAS]
[Головная страница]
[Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)