Тезисы докладов

Генетические основы биоразнообразия

Промоторы генов тРНК эукариот состоят из боксов А и В. Бокс А (11-12 н.п.) расположен в области ДНК, соответствующей 5'-концу D-плеча тРНК. Бокс В (11 н.п.) находится в области ДНК, соответствующей Т-петле тРНК. Был проведен анализ множеств выровненных последовательностей нуклеотидов в участках расположения боксов А и В из генов тРНК царств Protozoa, Plant, Metazoa, Archae и Eubacteria с помощью нового метода распознавания промоторов генов тРНК эукариот (pol III SCAN). Метод позволяет оценивать распределение нуклеотидов в каждой позиции бокса и множество взаимодействий между позициями внутри бокса и между боксами. По характеру перемежаемости позиций с высококонсервативными нуклеотидами и позиций с относительно вариабельным составом, боксы А и В были подразделены на модули. Каждый модуль боксов А и В представлен ограниченным числом вариантов. Комбинации вариантов разных модулей являются характерными для определенного типа генов тРНК и они консервативны у отдаленных видов царств Metazoa и Plant многоклеточных организмов. Конкретные сочетания разных модулей коррелируют с особенностями вторичной структуры ДНК на их стыке. Установлена связь между структурными особенностями промоторов генов тРНК и аминокислотной специфичностью молекулы тРНК. Иные комбинации структурных вариантов ДНК модулей были обнаружены у тех же типов тРНК Protozoa по сравнению с многоклеточными организмами. Нуклеотидная последовательность в области D-плеча генов тРНК у прокариот, где находится бокс А у эукариот, характеризуется крайней вариабельностью нуклеотидного состава. Только аденин в позиции 7 этого ундека-додекаолигонуклеотида является консервативным, тогда как в генах тРНК эукариот таких позиций несколько. В этой последовательности не обнаружены межпозиционные взаимодействия. В генах одного типа тРНК у разных видов прокариот структура промоторов может существенно отличаться. Последовательность нуклеотидов генов тРНК прокариот, там где находится бокс В у эукариот, более консервативная. Тем не менее, этот участок также структурно более вариабелен у прокариот по сравнению с генами тРНК эукариот. Таким образом, у эукариот структура ДНК в участках нахождения боксов А и В стала более консервативной по сравнению с генами тРНК прокариот. Полагая, что трансляционные функции тРНК остались неизменными в ходе эволюции, эти модификации в структуре генов тРНК следует отнести к возникновению внутригенного промотора. Анализ промоторов генов тРНК эукариот показал, что модульная их организация в состоянии обеспечить как уникальные особенности структуры каждому типу генов тРНК, так и групповые, что весьма важно для их экспрессии при необходимости формирования тРНК определенного состава.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:44:54)