Молекулярная эндокринология (стендовая сессия)
Transcription Regulatory Regions Database (TRRD) разрабатывается и поддерживается в Institute of Cytology and Genetics SB RAS (Nivosibirsk, Russia) с 1993. TRRD содержит экспериментальную информацию об особенностях структурно-функциональной организации регуляторных районов генов эукариот. Информация заносится в базу данных экспертами-биологами на основании аннотирования экспериментальных статей. Каждый вход в базу TRRD соответствует отдельному гену и содержит описание таких иерархических уровней регуляции транскрипции как 1) сайты связывания транскрипционных факторов; 2) регуляторные единицы (промоторы, энхансеры, сайленсеры); 3) регуляторные районы (5' 3' регуляторные районы, экзоны, интроны). Описание каждого уровня регуляции может включать как его структурные характеристики (последовательность, локализация), так и функциональные свойства (влияние на транскрипционную активность гена, специфичность функционирования на определенных стадиях клеточного цикла или этапах индивидуального развития, а также в конкретных типах клеток, тканях и органах). Помимо данных о регуляторных районах гена в базу вносятся также описания транскрипционных факторов, использованных в экспериментах по исследованию связывающей способности либо функциональной активности сайтов, паттерны экспрессии генов, а также ссылки на исходные публикации. TRRD является частю системы GeneExpress. Доступ к базе возможен по адресу http://www.bionet.nsc.ru/trrd/.
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции
Ваши комментарии Обратная связь |
[Головная страница] [Конференции] |
© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:45:21)