Информационная система "Конференции"

Тезисы докладов

Молекулярная эндокринология (стендовая сессия)

На основе информации о 55 генах из созданной нами базы данных Endocrine System Transcription Regulatory Regions Database (ES-TRRD, http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/papers/ignatieva/es-trrd/), являющейся специализированным разделом базы TRRD, представлены современные положения о регуляции транскрипции генов, контролирующих стероидогенез. В группу рассматриваемых генов входят 15 генов человека, 14 - мыши, 13 - крысы, 6 - коровы, 3 - овцы и по одному гену лошади, свиньи и лосося, которые кодируют ферменты синтеза стероидных гормонов, тропные и рилизинг- гормоны и их рецепторы, транскрипционные факторы и другие белки. На примере генов, кодирующих лабильный белок StAR мыши, фермент ароматазу и a субъединицу гликопротеинов человека проиллюстрировано, что регуляторные области генов, контролирующих стероидогенез, организованы сложным образом. Регуляторные единицы, входящие в их состав (промоторы, энхансеры, сайленсеры и др.) имеют различную протяженность, удаленность от старта транскрипции и включают в каждом случае уникальный набор сайтов связывания транскрипционных факторов. В описываемом подразделе ES-TRRD охарактеризовано 82 регуляторные единицы. В их числе 55 промоторов, 7 энхансеров и 7 негативных регуляторных областей. В регуляторных областях рассматриваемых генов с помощью различных экспериментальных подходов выявлены сайты связывания более 80 различных транскрипционных факторов. В их числе сайты связывания для таких хорошо известных факторов как CREB, NF1, AP1, Sp1, C/EBP, Pbx1, STAT3, STAT5, GR, AR, ER, NGFI-B, SF1, COUP-TF, Ptx1, Msx1, Pan1, GATA4, Brn2, Egr1, HNF4, AP2. Особую роль в регуляции транскрипции генов, контролирующих стероидогенез, играет транскрипционный фактор SF1. Этим фактором регулируются 39 из 55 рассматриваемых генов, в регуляторных областях которых выявлен 61 сайт связывания SF1. На основе выборки из TRRD 41 нуклеотидной последовательности, содержащей сайт связывания SF1 построен десятибуквенный консенсус сайта связывания этого фактора – GTCAAGGTCA и его частотная матрица. Наибольшие частоты имеют нуклеотиды, занимающие с 3 по 7 позиции в построенном декануклеотиде. Нуклеотиды, расположенные в консенсусе в 8, 9 и 10 положениях, встречаются в этих позициях с несколько меньшей вероятностью. Еще меньшие частоты имеют нуклеотиды в 1 и 2 положении консенсуса. Абсолютно необходимой для связывания с SF1 является пара гуаниновых нуклеотидов в 6 и 7 положениях консенсуса. Исходя из предположения о том, что ген SF1 может быть одним их локусов разработанной ранее авторами 4-локусной модели координированной регуляции тестикулярного стероидогенеза у мышей, проведен поиск потенциальных сайтов связывания данного фактора в регуляторных районах генов двух микросомальных ферментов биосинтеза тестостерона у этого вида. В 5’ фланкирующих областях генов Cyp17 и 3bГСД найдены соответственно 6 и 5 таких сайтов. Проанализированы белок-белковые взаимодействия транскрипционного фактора SF1 с другими регуляторными белками в процессе регуляции транскрипции генов, рассматриваемой системы. (Работа поддержана грантами РФФИ 00-07-90337 и 01-04-49523)

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии Обратная связь

[Головная страница] [Конференции]

© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:45:21)